Microbiote intestinal

Le microbiote intestinal ou flore intestinale représente des milliers d’espèces bactériennes, virales et fongiques, qui vivent en symbiose avec nous au cœur de nos intestins. C’est un véritable microcosme qui vit en nous, nous aide à digérer, à nous défendre des pathogènes et à influencer jusqu’à notre moral ! Les études sur le microbiote intestinal n’en sont qu’à leur début et chaque découverte scientifique ouvre le champ des possibles pour de futures thérapeutiques. Découvrons ensemble un peu mieux le microbiote intestinal, comment il nait, comment il vit mais aussi comment il peut s’abimer avec le temps et nous donner du fil à retordre :
Le microbiote intestinal c’est quoi ?
Naissance du microbiote intestinal
Nous avons tous un microbiote intestinal différent, composé de souches bactériennes, virales et fongiques qui nous sont propres. C’est comme une carte d’identité. Le microbiote se construit à la naissance du bébé lorsqu’il passe dans le vagin de sa mère et avale des bactéries au passage. Les bébés nés par césarienne, eux, vont construire leur microbiote avec les premières bactéries rencontrées, souvent celle de la salle d’accouchement. Le microbiote va continuer à se forger sur les premières années de vie. On considère qu’il est mâture après deux/trois ans de vie et ce microbiote ressemblera à notre microbiote de l’âge adulte. Certaines études récentes tendraient à penser que l’appendice serait une réserve de ce microbiote originel.
Quelques chiffres sur le microbiote intestinal
Le microbiote intestinal est le plus peuplé de nos microbiomes (cutané, ORL, vaginal, urinaire ou pulmonaire.) Il représente 100 000 milliards d’organismes répartis en milliers d’espèces bactériennes, virales, fongiques et même parasitaires. Il pèse presque 2 kilogrammes. Nous hébergeons plus d’organismes de microbiote que nous n’avons de cellules dans le corps !
A quoi ça sert le microbiote intestinal ?
Quand on connait la quantité de ces organismes vivant avec nous, on ne peut qu’imaginer leurs fonctions qui sont assez variées et qui nous sont indispensables :
Digestion
Tout ce petit monde se nourrit de ce que nous mangeons et le microbiote intestinal nous aide à digérer la nourriture. Il découpe les aliments grâce à ses enzymes. Il aide à traiter les nutriments non digestibles grâce à la putréfaction et la fermentation.
Fabrication de vitamines et d’acides aminés
Le microbiote participe activement à la synthèse des vitamines du groupe B et de la vitamine K notamment. Il est aussi partie prenante de la fabrication de certains acides aminés.
Immunité
Le microbiote intestinal est la première barrière physique entre nos intestins et notre système immunitaire. 60% des cellules de l’immunité se trouvent au niveau intestinal. Le microbiote intestinal nous aide à nous défendre contre les pathogènes. Il est comme « éduqué » dès le plus jeune âge à reconnaitre des bactéries amies des bactéries pathogènes. Le microbiote va donc aussi jouer un rôle dans le phénomène d’inflammation. Un microbiote sain et apaisé ne générera pas d’inflammation excessive.
Moral-stress
On parle souvent des intestins comme de notre deuxième cerveau. En effet le microbiote a une « âme » et va réagir à notre environnement et notre stress et communiquer avec notre cerveau. On a détecté des neurones au niveau intestinal qui « dialoguent » avec nos neurones cérébraux. Il y a donc un lien évident entre notre stress éprouvé, notre ventre et nos émotions. Le microbiote va être très sensibles à nos niveaux de stress et peut influencer notre humeur.
Quels sont les ennemis du microbiote intestinal ?
Malbouffe
Le microbiote intestinal aime bien manger, des aliments frais, vivants et le plus naturels possibles. Il n’aime pas les produits ultra transformés, les graisses saturées et les sucres en excès. Il ne reconnait pas toujours ces matrices déformées d’aliments et il est gêné par ces aliments « suspects », qui figurent d’ailleurs parmi les aliments qui augmentent les douleurs.
Toxines
Evidemment, le microbiote intestinal est fragile et peut être endommagés par les différentes toxines que nous absorbons :
- Médicaments, notamment antibiotiques qui vont décimer sa population.
- On peut aussi citer les anti-inflammatoires et les inhibiteurs de la pompe à protons qui déséquilibre le pH localement.
- Pesticides
- Additifs alimentaires
- Polluants atmosphériques
Stress
Comme nous l’avons évoqué, le stress et des taux de cortisol élevé vont exercer une influence néfaste sur le microbiote intestinal. Vous pouvez retrouver nos astuces naturelles contre le stress dans cet article.
Signes d’un microbiote intestinal perturbé
Lorsque le microbiote intestinal souffre, on parle de dysbiose. Les espèces ne vivent plus en symbiose, certaines bactéries prennent l’ascendant et perturbent le fonctionnement global du microbiote. On peut alors observer :
- Des ballonnements et gaz intestinaux
- De la diarrhée ou de la constipation
- Troubles de l’humeur, fatigue
- Problèmes de peau : acné, eczéma, …
- Modification de l’appétit et de la sensation de satiété
- Failles immunitaires : enchainement d’épisodes ORL par exemple.
- Inflammation globale, douleurs chroniques
Au long cours, la dysbiose s’installe et fait le lit de la porosité intestinale.

Comment prendre soin de son microbiote intestinal
Voici les actions holistiques à mener pour prendre soin de son microbiote intestinal :
Bien manger-Fibres
Veiller à adopter une alimentation variée, très végétale et vraie. Bannir les aliments ultra transformés, les graisses saturées et sucres en excès. Le microbiote se nourrit des fibres alimentaires, donc privilégier :
- Tous les fruits et légumes
- Les légumineuses
- Les oléagineux
- Les herbes aromatiques
Nous ne mangeons pas assez de fibres, on considère que trois adultes sur quatre est en carence de ces nutriments.
Gérer son stress et bouger
Nous vous le répétons assez : le stress et la sédentarité sont les ennemis jurés de la santé et du microbiote ! Pratiquer une activité physique, même modérée tous les jours, et bien respirer sont excellents pour notre microbiote qui aime s’oxygéner et bouger ! Lutter contre son stress en prenant soin de son sommeil et en adoptant tous ces anti-stress naturels vous aideront à garder votre microbiote intestinal en forme.
Limiter les toxines
Vous pouvez limiter les toxines en choisissant des aliments le moins traités lors de leur culture, de leur stockage et de leur transport. Adopter des aliments frais, de saison et locaux.
Abonder en bons nutriments
Enfin, un microbiote sain a besoin de bons nutriments essentiels pour bien fonctionner. Et notamment :
- Vitamine D, notamment en hiver, chef d’orchestre de l’immunité et vitamine star de l’intestin !
- Magnésium pour aider à mieux dormir et à gérer son stress
- Omégas 3
- Minéraux et oligo-éléments, avec des plasmas d’eaux de mer
- Probiotiques notamment lors de la prise d’antibiotiques.
A retenir :
Votre microbiote intestinal est comme une carte d’identité, constitué de milliards de bactéries, virus et champignons amis !
Il vit en symbiose avec nous et participe à notre digestion, notre immunité et notre moral
Il est fragile et sensible à notre environnement : attention au stress, à la malbouffe et aux toxines
On peut l’aider en soignant son alimentation, l’apport de bons nutriments, en bougeant plus et en stressant moins !
Estel BARRELLON
Docteure en pharmacie et naturopathe
Blog : Cuisiner pour se soigner
